财务、商务、吏务、学务、农务七部，以军议司原参谋处主事顾君恩为军务部部长。
六部之下，分设各科。
例如军务部掌管战兵、正兵和外系兵马的升赏、任免和军功的统筹工作，便分设职任科、典章科、掌功科、籍备科。
除此之外，增设城管局，下辖聚耕司、缉盐司与保安司。
聚耕司掌管各地农庄事宜，缉盐司主要设在山东境内和沿海靠河的城镇，将盐务继续抓在手里。
在其余大部分有增有升的时候，保安司却属于降格，被缉盐司和聚耕司分权，基本上只负责各个城镇的安保工作。
当然了，这个制度还只是处于最开始阶段，等到日后一定会有更加完善的系统出现，只是目前王争还没有想到。
崇祯十六年十一月十一日发生的事情，对山东军乃至整个天下格局的影响甚大，正是由此开始，王争手底下真正有了比较完善的制度，逐渐步入正轨。
这个事件，被称作“双十一政权”或“南京政权”的建立肇始，也是王争为了开创日后更大基业而迈出的第一步。
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