人发展到百万之众，所产生的矛盾是惊人地，成员结构也从清一色的黄埔同学变得十分复杂，鱼龙混杂，良莠不齐。
随着人员增加。机构开始变得庞大，部门之间地矛盾也变得尖锐起来，人事关系变得复杂起来，派系无可避免的进入这个以纪律严酷著称的团体，于是在很短时间内，按照地域分成了邓文仪代表的湖南派、胡宗南代表的浙江派、康泽代表的四川派、西南派（并非川滇黔，而是泛指两广福建云南），在这些地域派系中又掺杂了部门人事纠纷。所以在成立两年半之后，追求铁血，追求法西斯主义的蓝衣社在高层实际已经分裂了。
不过贺衷寒以他在黄埔和这数年时间里积累起来地威望，依然能够指挥蓝衣社，他是湖南人领袖和黄埔学生领袖，他通过湖南人和黄埔同学指挥着蓝衣社中枢大脑和主要外围组织。但对这个变得日益庞大的组织，他越来越有种无力感，组织内部的分裂和堕落他了如指掌，但他无力改变，因为他需要这些人的支持，他只能采取平衡术。
蓝衣社的形形色色的外组织在迅猛的推行中，与国民党原有体系发生激烈冲突，因此蓝衣社与政学系和cc系的矛盾也越来越大。蓝衣社地外围组织文化学会与cc系控制的文化建设协会在上海发生激烈冲突。蓝衣社干将任觉五发动了一场针对文化建设协会的围剿，他率众以武力攻击了上海暨南大学和中国公学的文化建设协会成员，逼迫他们签下退出文化建设协会的声明。随后又在南京暗杀了陈立夫控制十分严密的中央党务学校地三名学生。这三个人先是参加蓝衣社，后为cc系所控制的校方所逼退出蓝衣社。
在蓝衣社成立之初。陈立夫对他们还是有好感的，可
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