捉到中国军队主力，随即日军转入对武汉周边的攻击中。
占领武汉的日军没有停下脚步，继续向武汉周边地区进攻，在长江以北攻击随县枣阳，在长江以南开始肃清南浔线作战，局势依旧紧张。
由于一战区没有大的作战，蒋介石命令由卫立煌接任一战区司令，李宗仁正式接任五战区司令，集中精力指挥随县枣阳保卫战。而南浔线所有部队均受九战区前敌总指挥薛岳指挥。
长江南北战火依旧，蒋介石撤到重庆后，不再干涉前线将领指挥，将主要指挥工作交给了何应钦和白崇禧，他将主要精力转向筹划召开的国民党临时全国大会和五届四中全会，以及国民参政会。
抗战两年来，国际国内的政治、经济、军事都发生了重大变化，有必要召开一次全国大会。统一全党认识，整顿经济财政，整顿军队，总结两年来战争的经验教训。这个会议在武汉保卫战前就该开，但为布置武汉保卫战，蒋介石将会议拖后了，他本想保住武汉后在武汉召开，但战争的结果没能满足他的要求。
蒋介石到重庆后没有像其他国府高官那样住在临近市区的上清寺一带，而是像南京那样住在靠近中央军校的歌乐山，蒋介石到重庆前，庄继华和蒋经国就为他修建了三处官邸，分别在歌乐山、黄山（南山附近）和观音桥，蒋介石选择了歌乐山和黄山，观音桥官邸直接下令改为干部学校招待所。
蒋介石的大部分时间待在黄山官邸，黄山属于风景优美的南山山脉，满山青松翠柏，环境优雅，蒋介石住进来后，这块区域周围五里便成了禁区，布满警卫。
为了筹备五届四中全会，蒋介石住进南山后就频频召见在重庆的中央大员，汪精
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