人的舰队，科迪亚克级还能派上用场，甚至还能再用上不短的时间，可是随着GDI对思晶人的逐步了解——再加上那名活着的真正思晶人俘虏所提供的情报——他们明白，面对思晶人越来越快的生产能力，越来越多服役的星舰，单舰战斗力已经不足的科迪亚克级战巡舰，已经不够用了。
这也是海巨兽级重巡洋舰出现的原因。不同于科迪亚克级战巡舰那种多面手的泛用型角色，海巨兽级重巡洋舰从一开始，定位就是宇宙作战，是要同思晶人舰队争夺制宇权的星舰，所以其单舰火力相当强大，以比科迪亚克级战巡舰更小的舰体，却有着比战巡舰更强大的火力，专门用来打舰队战的。
因为这样的定位，海巨兽级在对地支援攻击上，反而不如科迪亚克级战巡舰这种老前辈了，甚至还没有搭载什么舰载机队的能力——只有少量用于护航穿梭机用的护航机，数量稀少到根本不能用来打制空战——所以在GDI各种舰队编制中，不管是警戒舰队还是巡逻舰队，甚至是防御舰队，都没有将海巨兽纳入编制。
GDI只是将这款星舰全部归属给一个特殊舰队编制，那就是所谓的司令部直属舰队。除了不想被外人染指这些新型星舰，以及海巨兽级数量还比较少外，直属舰队只有一个主要任务，就是对抗思晶人太空舰队，专门与之交战，其他的事都会交给其他舰队去负责——海巨兽级当然还有一个秘密任务，就是在某些己方舰队因各种原因失控反噬己方时，对其展开武力镇压，以它们的战斗力，除非是一整支轨道防御舰队叛变，否则不管是警戒舰队还是巡逻舰队，都会在极短时间内被它们快速消灭。
这也导致海巨兽级重巡洋舰在GDI
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